Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
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Gm20918J3QN17 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
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Gm20918J3QN17 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
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Gm20918J3QN17 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
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Gm20918J3QN17 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
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Gm20918J3QN17 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
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Gm20918J3QN17 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm20918J3QN17 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
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Gm20918J3QN17 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
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Gm20918J3QN17 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
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Gm20918J3QN17 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
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Gm20918J3QN17 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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Gm20918J3QN17 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
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Gm20918J3QN17 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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