Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms