Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Cldn20G5E8X0 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Cldn20G5E8X0 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Cldn20G5E8X0 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Cldn20G5E8X0 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Cldn20G5E8X0 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Cldn20G5E8X0 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Cldn20G5E8X0 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Cldn20G5E8X0 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cldn20G5E8X0 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cldn20G5E8X0 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cldn20G5E8X0 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn20G5E8X0 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn20G5E8X0 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn20G5E8X0 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn20G5E8X0 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn20G5E8X0 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn20G5E8X0 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn20G5E8X0 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn20G5E8X0 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn20G5E8X0 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn20G5E8X0 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn20G5E8X0 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn20G5E8X0 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn20G5E8X0 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn20G5E8X0 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn20G5E8X0 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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