Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Rnf148G3X9R7 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Rnf148G3X9R7 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Rnf148G3X9R7 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Rnf148G3X9R7 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms