Protein–RNA interactions for Protein: G3UW87

Gm17455, MCG55969, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17455G3UW87 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm17455G3UW87 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms