Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 AC165260.5-201ENSMUST00000224640 1247 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 1600019K03Rik-201ENSMUST00000187829 477 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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