Protein–RNA interactions for Protein: F6ZZG8

Gm5624, Predicted gene 5624 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5624F6ZZG8 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5624F6ZZG8 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms