Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms