Protein–RNA interactions for Protein: F6RSK3

Gm17430, Predicted gene, 17430, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17430F6RSK3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17430F6RSK3 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17430F6RSK3 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17430F6RSK3 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17430F6RSK3 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17430F6RSK3 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17430F6RSK3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17430F6RSK3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17430F6RSK3 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17430F6RSK3 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17430F6RSK3 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17430F6RSK3 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17430F6RSK3 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17430F6RSK3 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17430F6RSK3 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17430F6RSK3 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17430F6RSK3 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17430F6RSK3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17430F6RSK3 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17430F6RSK3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17430F6RSK3 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17430F6RSK3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17430F6RSK3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17430F6RSK3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17430F6RSK3 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17430F6RSK3 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17430F6RSK3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17430F6RSK3 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17430F6RSK3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17430F6RSK3 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17430F6RSK3 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17430F6RSK3 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17430F6RSK3 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17430F6RSK3 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17430F6RSK3 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17430F6RSK3 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm17430F6RSK3 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm17430F6RSK3 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm17430F6RSK3 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm17430F6RSK3 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm17430F6RSK3 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm17430F6RSK3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm17430F6RSK3 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm17430F6RSK3 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm17430F6RSK3 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17430F6RSK3 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17430F6RSK3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17430F6RSK3 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17430F6RSK3 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17430F6RSK3 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17430F6RSK3 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17430F6RSK3 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17430F6RSK3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17430F6RSK3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17430F6RSK3 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17430F6RSK3 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17430F6RSK3 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17430F6RSK3 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17430F6RSK3 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17430F6RSK3 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17430F6RSK3 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17430F6RSK3 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17430F6RSK3 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17430F6RSK3 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17430F6RSK3 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17430F6RSK3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17430F6RSK3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17430F6RSK3 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17430F6RSK3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17430F6RSK3 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17430F6RSK3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17430F6RSK3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17430F6RSK3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17430F6RSK3 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17430F6RSK3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17430F6RSK3 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17430F6RSK3 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17430F6RSK3 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17430F6RSK3 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17430F6RSK3 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17430F6RSK3 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17430F6RSK3 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17430F6RSK3 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17430F6RSK3 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17430F6RSK3 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17430F6RSK3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17430F6RSK3 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17430F6RSK3 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17430F6RSK3 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17430F6RSK3 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17430F6RSK3 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17430F6RSK3 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17430F6RSK3 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17430F6RSK3 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17430F6RSK3 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17430F6RSK3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17430F6RSK3 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17430F6RSK3 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17430F6RSK3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17430F6RSK3 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms