Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms