Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms