Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Rnf217D3YYI7 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Rnf217D3YYI7 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Rnf217D3YYI7 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Rnf217D3YYI7 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Rnf217D3YYI7 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
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Rnf217D3YYI7 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Rnf217D3YYI7 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
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Rnf217D3YYI7 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
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Rnf217D3YYI7 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
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Rnf217D3YYI7 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
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Rnf217D3YYI7 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Rnf217D3YYI7 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
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