Protein–RNA interactions for Protein: D3YU81

Rfx8, DNA-binding protein RFX8, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx8D3YU81 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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Rfx8D3YU81 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Rfx8D3YU81 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Rfx8D3YU81 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Rfx8D3YU81 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Rfx8D3YU81 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Rfx8D3YU81 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Rfx8D3YU81 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Rfx8D3YU81 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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