Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms