Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbed5B2RPU8 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbed5B2RPU8 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbed5B2RPU8 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbed5B2RPU8 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbed5B2RPU8 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbed5B2RPU8 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbed5B2RPU8 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbed5B2RPU8 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbed5B2RPU8 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbed5B2RPU8 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbed5B2RPU8 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbed5B2RPU8 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbed5B2RPU8 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbed5B2RPU8 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbed5B2RPU8 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbed5B2RPU8 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbed5B2RPU8 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbed5B2RPU8 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbed5B2RPU8 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbed5B2RPU8 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbed5B2RPU8 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbed5B2RPU8 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbed5B2RPU8 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbed5B2RPU8 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbed5B2RPU8 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbed5B2RPU8 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbed5B2RPU8 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbed5B2RPU8 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbed5B2RPU8 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbed5B2RPU8 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbed5B2RPU8 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbed5B2RPU8 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Zbed5B2RPU8 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed5B2RPU8 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed5B2RPU8 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed5B2RPU8 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed5B2RPU8 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed5B2RPU8 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed5B2RPU8 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed5B2RPU8 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed5B2RPU8 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed5B2RPU8 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed5B2RPU8 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed5B2RPU8 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed5B2RPU8 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed5B2RPU8 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed5B2RPU8 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed5B2RPU8 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed5B2RPU8 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed5B2RPU8 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed5B2RPU8 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed5B2RPU8 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed5B2RPU8 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed5B2RPU8 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed5B2RPU8 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed5B2RPU8 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed5B2RPU8 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed5B2RPU8 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed5B2RPU8 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed5B2RPU8 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed5B2RPU8 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed5B2RPU8 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed5B2RPU8 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed5B2RPU8 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed5B2RPU8 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed5B2RPU8 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed5B2RPU8 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed5B2RPU8 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zbed5B2RPU8 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zbed5B2RPU8 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zbed5B2RPU8 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zbed5B2RPU8 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zbed5B2RPU8 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zbed5B2RPU8 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zbed5B2RPU8 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zbed5B2RPU8 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zbed5B2RPU8 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zbed5B2RPU8 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zbed5B2RPU8 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zbed5B2RPU8 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zbed5B2RPU8 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zbed5B2RPU8 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zbed5B2RPU8 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Zbed5B2RPU8 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zbed5B2RPU8 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Zbed5B2RPU8 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Zbed5B2RPU8 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zbed5B2RPU8 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zbed5B2RPU8 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zbed5B2RPU8 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Zbed5B2RPU8 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zbed5B2RPU8 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zbed5B2RPU8 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zbed5B2RPU8 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Zbed5B2RPU8 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zbed5B2RPU8 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zbed5B2RPU8 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zbed5B2RPU8 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zbed5B2RPU8 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms