Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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