Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms