Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms