Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Atp8b5A3FIN4 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Atp8b5A3FIN4 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Atp8b5A3FIN4 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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