Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Samt1A2BED8 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Samt1A2BED8 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Samt1A2BED8 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Samt1A2BED8 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms