Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
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Rtf1A2AQ19 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Rtf1A2AQ19 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
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Rtf1A2AQ19 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Rtf1A2AQ19 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Rtf1A2AQ19 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms