Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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