Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramel3A2AHA7 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms