Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms