Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms