Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L1

Chd5, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 5, mousemouse

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Length 1,946 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd5A2A8L1 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chd5A2A8L1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chd5A2A8L1 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chd5A2A8L1 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chd5A2A8L1 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chd5A2A8L1 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chd5A2A8L1 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chd5A2A8L1 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chd5A2A8L1 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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