Protein–RNA interactions for Protein: A2A7Q9

Rnf19b, E3 ubiquitin-protein ligase RNF19B, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf19bA2A7Q9 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf19bA2A7Q9 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf19bA2A7Q9 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf19bA2A7Q9 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf19bA2A7Q9 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms