Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms