Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms