Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP7

Gm3238, MCG61407, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3238W4VSP7 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gm12022-201ENSMUST00000143311 1340 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Olfr358-201ENSMUST00000100146 1059 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gm15937-201ENSMUST00000120727 1235 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gm12171-201ENSMUST00000150895 1257 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gm28722-201ENSMUST00000187630 1036 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Smr2-203ENSMUST00000196477 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Olfr967-202ENSMUST00000213358 1210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Olfr811-201ENSMUST00000076437 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Olfr1301-201ENSMUST00000080094 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Smr2-201ENSMUST00000087043 676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 AC102431.1-201ENSMUST00000223773 1449 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Gm17540-201ENSMUST00000181617 1528 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Olfr770-202ENSMUST00000203887 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Olfr1081-ps1-201ENSMUST00000120210 945 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Gm8089-201ENSMUST00000122463 968 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Gm13499-201ENSMUST00000142804 603 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Gm16337-201ENSMUST00000160368 917 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Clec2i-204ENSMUST00000160867 933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Clec2i-205ENSMUST00000162666 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Gm7289-201ENSMUST00000168993 734 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Vmn2r-ps118-201ENSMUST00000176785 908 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Scgb2a2-201ENSMUST00000179814 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms