Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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