Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
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