Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms