Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z121

Ccl8, C-C motif chemokine 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl8Q9Z121 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl8Q9Z121 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms