Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV89

Stxbp4, Syntaxin-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp4Q9WV89 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stxbp4Q9WV89 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Stxbp4Q9WV89 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stxbp4Q9WV89 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stxbp4Q9WV89 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stxbp4Q9WV89 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stxbp4Q9WV89 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stxbp4Q9WV89 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stxbp4Q9WV89 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Stxbp4Q9WV89 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stxbp4Q9WV89 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Stxbp4Q9WV89 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stxbp4Q9WV89 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stxbp4Q9WV89 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Stxbp4Q9WV89 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Stxbp4Q9WV89 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Stxbp4Q9WV89 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stxbp4Q9WV89 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stxbp4Q9WV89 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stxbp4Q9WV89 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stxbp4Q9WV89 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stxbp4Q9WV89 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stxbp4Q9WV89 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stxbp4Q9WV89 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Stxbp4Q9WV89 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stxbp4Q9WV89 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stxbp4Q9WV89 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Stxbp4Q9WV89 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stxbp4Q9WV89 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stxbp4Q9WV89 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stxbp4Q9WV89 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stxbp4Q9WV89 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stxbp4Q9WV89 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stxbp4Q9WV89 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stxbp4Q9WV89 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Stxbp4Q9WV89 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stxbp4Q9WV89 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stxbp4Q9WV89 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stxbp4Q9WV89 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stxbp4Q9WV89 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Stxbp4Q9WV89 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stxbp4Q9WV89 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stxbp4Q9WV89 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stxbp4Q9WV89 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stxbp4Q9WV89 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stxbp4Q9WV89 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stxbp4Q9WV89 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stxbp4Q9WV89 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Stxbp4Q9WV89 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stxbp4Q9WV89 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stxbp4Q9WV89 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stxbp4Q9WV89 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stxbp4Q9WV89 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stxbp4Q9WV89 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stxbp4Q9WV89 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stxbp4Q9WV89 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stxbp4Q9WV89 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stxbp4Q9WV89 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stxbp4Q9WV89 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Stxbp4Q9WV89 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Stxbp4Q9WV89 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Stxbp4Q9WV89 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Stxbp4Q9WV89 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Stxbp4Q9WV89 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stxbp4Q9WV89 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stxbp4Q9WV89 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stxbp4Q9WV89 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stxbp4Q9WV89 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stxbp4Q9WV89 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stxbp4Q9WV89 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stxbp4Q9WV89 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stxbp4Q9WV89 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stxbp4Q9WV89 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stxbp4Q9WV89 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stxbp4Q9WV89 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stxbp4Q9WV89 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stxbp4Q9WV89 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stxbp4Q9WV89 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stxbp4Q9WV89 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stxbp4Q9WV89 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stxbp4Q9WV89 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stxbp4Q9WV89 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stxbp4Q9WV89 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Stxbp4Q9WV89 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Stxbp4Q9WV89 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stxbp4Q9WV89 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stxbp4Q9WV89 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Stxbp4Q9WV89 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Stxbp4Q9WV89 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Stxbp4Q9WV89 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stxbp4Q9WV89 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stxbp4Q9WV89 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stxbp4Q9WV89 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stxbp4Q9WV89 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stxbp4Q9WV89 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stxbp4Q9WV89 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stxbp4Q9WV89 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stxbp4Q9WV89 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stxbp4Q9WV89 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stxbp4Q9WV89 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms