Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU84

Ccs, Copper chaperone for superoxide dismutase, mousemouse

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Length 274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcsQ9WU84 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcsQ9WU84 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcsQ9WU84 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcsQ9WU84 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcsQ9WU84 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcsQ9WU84 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcsQ9WU84 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcsQ9WU84 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcsQ9WU84 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CcsQ9WU84 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcsQ9WU84 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcsQ9WU84 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcsQ9WU84 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcsQ9WU84 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CcsQ9WU84 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CcsQ9WU84 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcsQ9WU84 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CcsQ9WU84 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CcsQ9WU84 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcsQ9WU84 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcsQ9WU84 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CcsQ9WU84 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcsQ9WU84 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcsQ9WU84 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcsQ9WU84 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcsQ9WU84 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcsQ9WU84 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcsQ9WU84 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcsQ9WU84 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcsQ9WU84 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcsQ9WU84 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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