Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psma4Q9R1P0 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms