Protein–RNA interactions for Protein: Q9R053

Scn11a, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, mousemouse

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Length 1,765 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn11aQ9R053 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn11aQ9R053 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn11aQ9R053 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn11aQ9R053 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn11aQ9R053 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Scn11aQ9R053 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Scn11aQ9R053 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn11aQ9R053 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn11aQ9R053 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn11aQ9R053 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn11aQ9R053 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn11aQ9R053 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn11aQ9R053 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn11aQ9R053 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn11aQ9R053 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn11aQ9R053 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn11aQ9R053 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn11aQ9R053 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn11aQ9R053 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn11aQ9R053 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn11aQ9R053 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn11aQ9R053 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn11aQ9R053 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn11aQ9R053 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn11aQ9R053 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn11aQ9R053 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn11aQ9R053 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn11aQ9R053 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn11aQ9R053 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn11aQ9R053 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn11aQ9R053 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn11aQ9R053 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn11aQ9R053 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn11aQ9R053 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn11aQ9R053 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn11aQ9R053 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn11aQ9R053 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn11aQ9R053 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Scn11aQ9R053 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn11aQ9R053 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn11aQ9R053 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn11aQ9R053 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn11aQ9R053 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn11aQ9R053 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn11aQ9R053 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn11aQ9R053 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn11aQ9R053 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn11aQ9R053 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn11aQ9R053 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn11aQ9R053 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn11aQ9R053 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Scn11aQ9R053 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn11aQ9R053 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn11aQ9R053 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn11aQ9R053 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn11aQ9R053 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn11aQ9R053 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn11aQ9R053 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn11aQ9R053 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn11aQ9R053 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn11aQ9R053 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn11aQ9R053 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn11aQ9R053 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Scn11aQ9R053 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn11aQ9R053 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn11aQ9R053 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Scn11aQ9R053 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn11aQ9R053 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn11aQ9R053 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn11aQ9R053 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn11aQ9R053 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn11aQ9R053 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn11aQ9R053 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn11aQ9R053 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn11aQ9R053 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn11aQ9R053 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn11aQ9R053 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn11aQ9R053 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn11aQ9R053 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn11aQ9R053 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn11aQ9R053 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn11aQ9R053 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn11aQ9R053 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn11aQ9R053 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn11aQ9R053 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn11aQ9R053 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn11aQ9R053 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn11aQ9R053 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn11aQ9R053 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn11aQ9R053 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn11aQ9R053 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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