Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms