Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

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Length 1,682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Col4a4Q9QZR9 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Col4a4Q9QZR9 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Col4a4Q9QZR9 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
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