Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL0

Ripk3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk3Q9QZL0 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms