Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
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