Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

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Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms