Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY31

Snai3, Zinc finger protein SNAI3, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai3Q9QY31 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Snai3Q9QY31 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms