Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

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Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Cpsf3Q9QXK7 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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