Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms