Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PdcQ9QW08 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms