Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Dkk3Q9QUN9 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Dkk3Q9QUN9 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Dkk3Q9QUN9 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Dkk3Q9QUN9 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dkk3Q9QUN9 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms