Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Vmn1r-ps144-201ENSMUST00000177291 939 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 CT025561.1-201ENSMUST00000214972 674 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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SrfQ9JM73 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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SrfQ9JM73 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
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SrfQ9JM73 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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SrfQ9JM73 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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SrfQ9JM73 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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SrfQ9JM73 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Gm17917-201ENSMUST00000218561 953 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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