Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms